%Original author :Theodore P.~Pavlic %Author: Frédéric CHEVALIER %Created in: 2009-11-29 %Modified in: 2023-04-06 %source: http://links.tedpavlic.com/tex/tpavlic_cv.tex %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% %% NOTE: If you find that it says %% %% %% %% 1 of ?? %% %% %% %% at the bottom of your first page, this means that the AUX file %% %% was not available when you ran LaTeX on this source. Simply RERUN %% %% LaTeX to get the ``??'' replaced with the number of the last page %% %% of the document. The AUX file will be generated on the first run %% %% of LaTeX and used on the second run to fill in all of the %% %% references. %% %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% Document Setup %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% % Don't like 10pt? Try 11pt or 12pt \documentclass[10pt]{article} \usepackage[utf8]{inputenc} \usepackage[T1]{fontenc} \usepackage{ucs} \usepackage[frenchb]{babel} % This is a helpful package that puts math inside length specifications \usepackage{calc} % This is a helpful package that puts color in your document \usepackage{xcolor} % This is a helpful package that format footnote \usepackage{footmisc} % Layout: Puts the section titles on left side of page \reversemarginpar % % PAPER SIZE, PAGE NUMBER, AND DOCUMENT LAYOUT NOTES: % % The next \usepackage line changes the layout for CV style section % headings as marginal notes. It also sets up the paper size as either % letter or A4. By default, letter was used. If A4 paper is desired, % comment out the letterpaper lines and uncomment the a4paper lines. % % As you can see, the margin widths and section title widths can be % easily adjusted. % % ALSO: Notice that the includefoot option can be commented OUT in order % to put the PAGE NUMBER *IN* the bottom margin. This will make the % effective text area larger. % % IF YOU WISH TO REMOVE THE ``of LASTPAGE'' next to each page number, % see the note about the +LP and -LP lines below. Comment out the +LP % and uncomment the -LP. % % IF YOU WISH TO REMOVE PAGE NUMBERS, be sure that the includefoot line % is uncommented and ALSO uncomment the \pagestyle{empty} a few lines % below. % %% Use these lines for letter-sized paper %\usepackage[paper=letterpaper, % %includefoot, % Uncomment to put page number above margin % marginparwidth=1.2in, % Length of section titles % marginparsep=.05in, % Space between titles and text % margin=1in, % 1 inch margins % includemp]{geometry} %% Use these lines for A4-sized paper \usepackage[paper=a4paper, includefoot, % Uncomment to put page number above margin marginparwidth=30.5mm, % Length of section titles marginparsep=1.5mm, %1.5mm, % Space between titles and text margin=10mm, %22.5mm, % 25mm margins includemp]{geometry} %% More layout: Get rid of indenting throughout entire document \setlength{\parindent}{0in} %% This gives us fun enumeration environments. compactitem will be nice. \usepackage{paralist} %% Reference the last page in the page number % % NOTE: comment the +LP line and uncomment the -LP line to have page % numbers without the ``of ##'' last page reference) % % NOTE: uncomment the \pagestyle{empty} line to get rid of all page % numbers (make sure includefoot is commented out above) % \usepackage{fancyhdr,lastpage} \pagestyle{fancy} %\pagestyle{empty} % Uncomment this to get rid of page numbers \fancyhf{}\renewcommand{\headrulewidth}{0pt} \fancyfootoffset{\marginparsep+\marginparwidth} \newlength{\footpageshift} \setlength{\footpageshift} {0.5\textwidth+0.5\marginparsep+0.5\marginparwidth-2in} \lfoot{\hspace{\footpageshift}% \parbox{4in}{\, \hfill % \arabic{page} sur \protect\pageref*{LastPage} % +LP % \arabic{page} % -LP \hfill \,}} % Finally, give us PDF bookmarks \usepackage{color,hyperref} \definecolor{darkblue}{rgb}{0.0,0.0,0.3} \definecolor{orange}{rgb}{0.8,0.5,0.2} \hypersetup{colorlinks, breaklinks, linkcolor=orange, urlcolor=orange, anchorcolor=orange, citecolor=orange} %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% End Document Setup %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% Helper Commands %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% % The title (name) with a horizontal rule under it % % Usage: \makeheading{name} % % Place at top of document. It should be the first thing. \newcommand{\makeheading}[1]% {\hspace*{-\marginparsep minus \marginparwidth}% \begin{minipage}[t]{\textwidth+\marginparwidth+\marginparsep}% {\large \bfseries #1}\\[-0.15\baselineskip]% \rule{\columnwidth}{1pt}% \end{minipage}} % The section headings % % Usage: \section{section name} % % Follow this section IMMEDIATELY with the first line of the section % text. Do not put whitespace in between. That is, do this: % % \section{My Information} % Here is my information. % % and NOT this: % % \section{My Information} % % Here is my information. % % Otherwise the top of the section header will not line up with the top % of the section. Of course, using a single comment character (%) on % empty lines allows for the function of the first example with the % readability of the second example. \renewcommand{\section}[2]% {\pagebreak[2]\vspace{2\baselineskip}% original : \pagebreak[2]\vspace{2.5\baselineskip \phantomsection\addcontentsline{toc}{section}{#1}% \hspace{0in}% \marginpar{ % \raggedright \scshape \textcolor{blue}{#1}}#2}%colored section \raggedright \scshape #1}#2}%classical section % An itemize-style list with lots of space between items \newenvironment{outerlist}[1][\enskip\textbullet]% {\begin{itemize}[#1]}{\end{itemize}% \vspace{-.6\baselineskip}} % An environment IDENTICAL to outerlist that has better pre-list spacing % when used as the first thing in a \section \newenvironment{lonelist}[1][\enskip\textbullet]% {\vspace{-\baselineskip}\begin{list}{#1}{% \setlength{\partopsep}{0pt}% \setlength{\topsep}{0pt}}} {\end{list} \vspace{-.6\baselineskip}} % An itemize-style list with little space between items \newenvironment{innerlist}[1][\enskip\textbullet]% {\begin{compactitem}[#1]}{\end{compactitem}} \newenvironment{innerlist2}[1][\enskip -]% {\begin{compactitem}[#1]}{\end{compactitem}} \newenvironment{innerlist3}[1][\enskip $\succ$]% {\begin{compactitem}[#1]}{\end{compactitem}} % To add some paragraph space between lines. % This also tells LaTeX to preferably break a page on one of these gaps % if there is a needed pagebreak nearby. \newcommand{\blankline}{\quad\pagebreak[2]} % Footnote style \DefineFNsymbols*{asterisks}{*{**}{***}{****}{*****}{******}{*******}} \setfnsymbol{asterisks} \renewcommand{\thefootnote}{\fnsymbol{footnote}} %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% End Helper Commands %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% Begin CV Document %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% \begin{document} % Limit word running into margins \emergencystretch 3em \makeheading{Frédéric CHEVALIER \hfill \scriptsize{revised version: 06/04/2023}} %----------------------------------- \section{Informations personnelles} %----------------------------------- % Nom : CHEVALIER \\ Prénom : Frédéric \\ Genre : Masculin \\ Date de naissance : 15 mai 1984 \\ Nationalité : Française %--------------------------- \section{Contact personnel} %--------------------------- % % NOTE: Mind where the & separators and \\ breaks are in the following % table. % % ALSO: \rcollength is the width of the right column of the table % (adjust it to your liking; default is 1.85in). % \newlength{\rcollength}\setlength{\rcollength}{6.5cm}% % \begin{tabular}[t]{@{}p{\textwidth-\rcollength}p{\rcollength}} 9102 Wuthering Heights & \\ San Antonio & \textit{Tel.:} +1 210 887 1716 \\ Texas 78254 -- USA & \textit{E-mail:} \href{mailto:frederic.d.chevalier@gmail.com} {frederic.d.chevalier@gmail.com}\\ \end{tabular} %------------------------------- \section{Contact professionnel} %------------------------------- % % NOTE: Mind where the & separators and \\ breaks are in the following % table. % % ALSO: \rcollength is the width of the right column of the table % (adjust it to your liking; default is 1.85in). % Position: Staff scientist \blankline % \begin{tabular}[t]{@{}p{\textwidth-\rcollength}p{\rcollength}} \href{http://txbiomed.org/}% {Texas Biomedical Research Institute} & \textit{Tel.:} +1 210 258 9277 \\ P.O. Box 760549 & \textit{E-mail:} \href{mailto:fcheval@txbiomed.org} {fcheval@txbiomed.org} \\ San Antonio & \textit{www:} \href{https://www.txbiomed.org/scientists/frederic-chevalier-ph-d/}{TxBiomed webpage} \\ Texas 78245-0549 -- USA & \textit{ORCID:} \href{http://orcid.org/0000-0003-2611-8106}{0000-0003-2611-8106} \\ \end{tabular} %----------------------------- \section{Thèmes de recherche} %----------------------------- % Interaction hôte-symbiote, microbiome, biologie des vecteur, immunité des invertébrés, pharmaco-résistance, génétique mendélienne, génomique des populations %-------------------------------------- \section{Expériences professionnelles} %-------------------------------------- % \textbf{Adjunct Assistant Professor}% \hfill \textbf{Janvier 2019 à maintenant} \begin{outerlist} \item[] \href{https://www.uthscsa.edu/}{\textbf{Univerity of Texas Health}}, San Antonio, Texas, USA \begin{innerlist} \item \href{https://lsom.uthscsa.edu/biochemistry/team-member/frederic-chevalier-phd/}{Department of Biochemistry and Structural Biology} \end{innerlist} \end{outerlist} \blankline \textbf{Staff scientist}% \hfill \textbf{Février 2017 à maintenant} \begin{outerlist} \item[] \href{http://txbiomed.org}{\textbf{Texas Biomedical Research Institute}}, San Antonio, Texas, USA \begin{innerlist} \item \href{https://www.txbiomed.org/research/host-pathogen-interactions}{Host-Pathogen Interactions Program} \item Laboratoire du \href{mailto:tanderso@txbiomed.org}{Pr. Tim ANDERSON} \item Projets: \begin{innerlist2} \item Spécificité d'hôte dans le système \emph{Schistosoma mansoni} / \emph{Biomphalaria} : base génétique de la compatibilité chez le schistosome \item Pharmaco-résistance chez le schistosome (oxamniquine, praziquantel) \item Génomique des populations de schistosomes \item Microbiomes des escargots vecteurs de la schistosomiase \item Facteur immunitaire chez l'escargot (activité laccase) \end{innerlist2} \end{innerlist} \end{outerlist} \blankline \textbf{Post-doctorat}% \hfill \textbf{Mars 2012 à Février 2017} \begin{outerlist} \item[] \href{http://txbiomed.org}{\textbf{Texas Biomedical Research Institute}}, San Antonio, Texas, USA \begin{innerlist} \item Sujet : Spécificité d'hôte chez \emph{Schistosoma mansoni} : identification des gènes impliqués dans le phénotype de compatibilité avec son hôte \emph{Biomphalaria glabratra}. \begin{innerlist2} \item Supervision : \href{mailto:tanderso@txboimedical.org} {Pr. Tim ANDERSON} \item Fincancement : \href{http://projectreporter.nih.gov/project_info_details.cfm?aid=8222346&icde=12132801}{NIH-NIAID Grant -- Genetic analysis of host specificity in \emph{Schistosoma mansoni}} (n$^{\circ}$1R01AI097576-01) \end{innerlist2} \end{innerlist} \end{outerlist} \blankline %\textbf{Attaché Temporaire à l'Enseignement et à la Recherche}% \textbf{ATER}% \hfill \textbf{Octobre 2010 à Septembre 2011} \begin{outerlist} \item[] \href{http://www.univ-poitiers.fr/}{\textbf{Université de Poitiers}}, Poitiers, France \begin{innerlist} \item Niveau Master -- Enseignements : 16h TD / 37h TP -- Matières : Immunologie, Écophysiologie, Chromatographie %\begin{innerlist} %\item Enseignements : 16h TD -- 37h TP %\item Domaines : Immunologie, Écophysiologie %\item Masters d'importance : %\begin{innerlist2} %\item Master Recherche Biologie, Écologie, Évolution %\item Master \textit{Erasmus Mundus} EMAE (\textit{European Master in Applied Ecology}) %\end{innerlist2} %\end{innerlist} \item Niveau Licence -- Enseignements : 54h TD / 112h TP -- Matières : Fonctions sensorielles, Neuroanatomie, Évolution des plans d'organisation, Diversité du Vivant, Organismes \& Milieux %\begin{innerlist} %\item Enseignements : 54h TD -- 112h TP %\item Domaines : Fonctions sensorielles, Neuroanatomie, Évolution des plans d'organi$\-$sation, Diversité du Vivant, Organismes \& Milieux %\item Licences d'importance : %\begin{innerlist2} %\item Licence Écologie et Biologie des Organismes %\item Licence Science de la Vie et Géologie %\end{innerlist2} \end{innerlist} \end{outerlist} %---------------- \section{Cursus} %---------------- % \textbf{Doctorat} \hfill \textbf{Octobre 2007 à Juin 2011} \begin{outerlist} \item[] \href{http://www.univ-poitiers.fr/}{\textbf{Université de Poitiers}}, Poitiers, France \begin{innerlist} \item Sujet de thèse : Symbiose à \emph{Wolbachia} ($\alpha$-protéobactérie) : impacts sur le système immunitaire et l'immunocompétence de son hôte \emph{Armadillidium vulgare} (crustacé isopode) \begin{innerlist2} \item Directeurs : \href{mailto:christine.braquart@univ-poitiers.fr}{Dr. Christine BRAQUART-VARNIER} -- \href{mailto:pierre.greve@univ-poitiers.fr}{Pr. Pierre GRÈVE} \item Financement : Allocations \href{http://dr.education.fr/Alloc_doc/}{ministérielle} et de monitorat \item[] \end{innerlist2} \end{innerlist} \end{outerlist} \blankline \textbf{Monitorat}% \hfill \textbf{Octobre 2007 à 2010} \begin{outerlist} \item[] \href{http://www.univ-poitiers.fr/}{\textbf{Université de Poitiers}}, Poitiers, France \begin{innerlist} \item Niveau Master -- Enseignements : 16h TD / 37h TP -- Matières : Ecophysiologie, Chromatographie %\item Enseignements : 16h TD / 37h TP -- Matière : Ecophysiologie %\item Matière : Ecophysiologie %\item Masters d'importance : %\begin{innerlist2} %\item Master Recherche Biologie, Écologie, Évolution %\item Master \textit{Erasmus Mundus} EMAE (\textit{European Master in Applied Ecology}) %\end{innerlist2} %\end{innerlist} \item Niveau Licence -- Enseignements : 6h TD / 74h TP -- Matières : Fonctions sensorielles, Neuroanatomie, Évolution des plans d'organisation %\begin{innerlist} %\item Enseignements : 6h TD -- 74h TP %\item Domaines : Fonctions sensorielles, Neuroanatomie, Évolution des plans d'organi$\-$sation %\item Licences d'importance : %\begin{innerlist2} %\item Licence Écologie et Biologie des Organismes %\item Licence Biologie, Géologie, Sciences de la Terre et de l'Univers %\item Licence Science de la Vie et Géologie %\end{innerlist2} \end{innerlist} \end{outerlist} \blankline \textbf{Master Écologie fonctionnelle : des molécules aux populations naturelles} (mention Bien) -- Responsable : \href{mailto:mitta@univ-perp.fr}{Pr. Guillaume MITTA} \hfill \textbf{Septembre 2005 à Juin 2007} \begin{outerlist} \item[] \href{http://www.univ-perp.fr/fr/index.html}{\textbf{Université Via Domitia}}, Perpignan, France % \begin{innerlist} % \item Stage Master 1 : La compatibilité dans le modèle \emph{Biomphalaria glabrata}/\emph{Echino$\-$stoma caproni} : banques SSH et expression tissulaire de gènes candidats \hfill \textbf{Janvier 2006 à Juin 2006} % \begin{innerlist2} % \item Directeur: \href{mailto:mitta@univ-perp.fr}{Professeur Guillaume MITTA} % \end{innerlist2} % \end{innerlist} % \begin{innerlist} % \item Stage Master 1 (hors-cursus) : Histoire de LARD (\emph{Large Retrotransposon Derivative}) : Évolution de l'élément Dasheng au sein du genre \emph{Oriza} \hfill \textbf{Juillet 2006 à Septembre 2006} % \begin{innerlist2} % \item Directeur : \href{mailto:panaud@univ-perp.fr}{Professeur Olivier PANAUD} % \end{innerlist2} % \end{innerlist} % \begin{innerlist} % \item Stage Master 2 : Variation intra-spécifique de virulence dans le modèle hôte/para$\-$sitoïde \emph{Drosophila melanogaster}/\emph{Leptopilina boulardi}: recherche de protéines cibles d'un facteur de virulence \hfill \textbf{Janvier 2007 à Juin 2007} % \begin{innerlist2} % \item Directeur : \href{mailto:poirie@antibes.inra.fr}{Professeur Marylène POIRIÉ} % \item Financement : \href{http://wwww.enseignementsup-recherche.gouv.fr/enseignementsup/bourses.htm/}{Bourse au mérite} % \end{innerlist2} % \end{innerlist} \end{outerlist} \blankline \textbf{Licence Phytosciences} (mention Bien) \hfill \textbf{Septembre 2002 à Juin 2005} \begin{outerlist} \item[] \href{http://www.univ-perp.fr/fr/index.html}{\textbf{Université Via Domitia}}, Perpignan, France \end{outerlist} %----------------------------------- \section{Compétences \\ Techniques} %----------------------------------- % \textit{Compétences expérimentales} \begin{outerlist} \item \textbf{Acides nucléiques} : extraction d'ADN et d'ARN, PCR, RT-PCR, qPCR, clonage, séquençage, banques (soustractives, RNA-seq, captude d'exome), hybridation \textit{in situ}, \item \textbf{Protéines} : Western blot, quantification d'activité enzymatique, expression de protéines en système hétérologue, détection d'interactions (double hybride), purification de protéines par HPLC \item \textbf{Biologie cellulaire} : cytométrie en flux, marquage apoptose (TUNEL et Annexin), séparation de cellules sur gradient, comptage de cellules, microscopie (épifluorescente, confocale) \item \textbf{Microbiologie} : cultures de champignons, cultures de bactéries, injections de bactéries \item \textbf{Élevage} : mouches (\emph{Drosophila}), cloportes (isopodes terrestres), escargots aquatiques (\emph{Biomphalaria} et \emph{Lymnea}), schistosomes (\emph{Schistosoma mansoni}) \end{outerlist} \blankline \textit{Compétences bioinformatiques} \begin{outerlist} \item \textbf{Recherche de similarités de séquences} : \href{http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi}{\textsc{Blast}}, \href{http://crisceb.unina2.it/angelo/PROTEIN_TOOLS/PROSCAN/}{ProScan}, \href{http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi}{Conserved Domain Search} \item \textbf{Alignement de séquences et phylogénie} : \href{http://www.clustal.org/}{Clustal}, \href{http://guidance.tau.ac.il/overview.html}{Guidance}, \href{http://bioinfo.genotoul.fr/multalin/multalin.html}{\textsc{Multalin}}, \href{http://mafft.cbrc.jp/alignment/software/}{\textsc{Mafft}}, \href{http://www.ebi.ac.uk/goldman-srv/prank/prank/}{\textsc{Prank}}, \href{http://droog.gs.washington.edu/polyphred/}{\textsc{PolyPhred}} \item \textbf{Analyse de survie} : \href{http://en.wikipedia.org/wiki/Logrank_test}{LogRank test} et \href{http://en.wikipedia.org/wiki/Proportional_hazards_models}{Cox Models} \item \textbf{Outils relatifs aux nouvelles techniques de séquençage} : \begin{innerlist} \item Assemblage / alignement de \emph{reads}: \href{http://sourceforge.net/apps/mediawiki/mira-assembler/index.php?title=Main_Page}{\textsc{Mira}} (assemblage), \href{http://www.phrap.org/phredphrapconsed.html}{Phred / Phrap / Consed} (assemblage), \href{http://samtools.sourceforge.net/}{SAMtools} (alignement), \href{http://www.sanger.ac.uk/resources/software/artemis/}{Artemis} (assemblage), \href{http://bio-bwa.sourceforge.net/}{BWA} (alignement), \href{https://github.com/alexdobin/STAR}{STAR} (alignement de données RNA-seq et \emph{single-cell} RNA-seq) \item Identification / filtration de variants: \href{https://software.broadinstitute.org/gatk/}{GATK}, \href{https://github.com/freebayes/freebayes}{FreeBayes}, \href{http://bedtools.readthedocs.io/en/latest/}{Bedtools}, \href{https://vcftools.github.io/index.html}{vcftools} \item Analyse des données: mise en place de \emph{workflows} via \href{https://snakemake.readthedocs.io/en/stable/}{Snakemake}, utilisation de \href{https://www.r-project.org/}{R} (analyse génétique (QTL et GWAS), représentation graphique) \end{innerlist} \item \textbf{Reproductibilité et partage de code} : \begin{innerlist} \item Utilisation de \href{https://jupyter.org/}{Jupiter Notebooks} pour détailler chaque projet et commenter les étapes d'analyse. \item Utilisation d'environments définis pour chaque projet via \href{https://conda.io/projects/conda/en/latest/user-guide/tasks/manage-environments.html}{Conda}. \item Utilisation de Github pour partager notebooks et scripts d'analyse (mon \href{https://github.com/fdchevalier}{compte Github}). \item Dépôt des sequences sur \href{https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra}{SRA} et des fichiers connexes aux analyses sur \href{https://zenodo.org/}{Zenodo}. \end{innerlist} \end{outerlist} %--------------------------------- \section{Encadrement d'étudiants} %--------------------------------- % \textbf{Doctorat}: \begin{innerlist} \item Stephanie NORDMEYER \hfill \mbox{\textbf{Septembre 2019 à maintenant}} \begin{innerlist2} \item Sujet: \emph{Role of snail microbiome in the interaction snail-schistosome} %\\ \null \hfill \mbox{\textbf{September 2019 to present}} % \hfill \textbf{May to July 2019} \item Direction: Frédéric Chevalier, Winka Le Clec'h, Tim Anderson \end{innerlist2} \end{innerlist} \blankline \textbf{Master} : \begin{innerlist} \item Stephanie NORDMEYER (Graduate student) \hfill \mbox{\textbf{Mai à Juillet 2019}} \begin{innerlist2} \item Sujet: \emph{Development of a schistosome sporocyst encapsulation assay} %\\ \null \hfill \mbox{\textbf{Mai à Juillet 2019}} % \hfill \textbf{May to July 2019} \end{innerlist2} \item Joa MANGOMBI (M1) \hfill \textbf{Avril à Juin 2011} \begin{innerlist2} \item Sujet : Caractérisation du type d'activité phénoloxydase chez les isopodes terrestres \end{innerlist2} \end{innerlist} \blankline \textbf{Licence} : \begin{innerlist} \item Nina ENG (Undergraduate - eq. L2) \hfill \textbf{Mai à Août 2014} \begin{innerlist2} \item Sujet : \emph{Oxamniquine resistance alleles in a Brazilian schistosome population} \end{innerlist2} \item Romain PIGEAULT (L3) \hfill \textbf{Mai à Juin 2010} \begin{innerlist2} \item Sujet : Caractérisation des fonctions hémocytaires chez \emph{Armadillidium vulgare} \end{innerlist2} \end{innerlist} %---------------------------------- \section{Financement de recherche} %---------------------------------- % \textbf{\href{https://www.nih.gov/}{National Institutes of Health}} \begin{outerlist} \item Projet: \emph{Role of the microbiome of the schistosome snail host} \begin{innerlist2} \item Year: 2022-2024 \item Grant number: 1R21AI171601-01 \item Amount: \$247,500 \item Role: MPI \end{innerlist2} \end{outerlist} \blankline \textbf{\href{https://forum.txbiomed.org/}{Texas Biomed Forum grants}} \begin{outerlist} \item Projet: \emph{Single cell profiling of schistosome sporocysts} \begin{innerlist2} \item Year: 2023 \item Grant number: 23-05070 \item Amount: \$60,000 \item Role: Co-PI \end{innerlist2} %\blankline \item Projet: \emph{Genetic manipulation of schistosome parasites} \begin{innerlist2} \item Year: 2015 \item Grant number: 15-04566 \item Amount: \$40,000 \item Role: Co-I \end{innerlist2} %\blankline \item Projet: \emph{The microbiome of the schistosome snail host} \begin{innerlist2} \item Year: 2014 \item Grant number: 14-04491 \item Amount: \$40,000 \item Role: Co-PI \end{innerlist2} %\blankline \item Projet: \emph{Genomic analysis of schistosome hybridization} \begin{innerlist2} \item Year: 2014 \item Grant number: 14-04488 \item Amount: \$50,000 \item Role: Co-I \end{innerlist2} \end{outerlist} %---------------------- \section{Publications} %---------------------- % \textit{Sélection d'articles de recherche (liste complète en annexe)} \begin{outerlist} %\item \textit{Endosymbiosis in Arthropods: evidence for a symbiotic syndrome?}. Yves Moné, Marie-Christine Carpentier, Natacha Kremer, Vincent Raquin, Claire Valiente Moro, Carole Vincent-Monégat, \textbf{Frédéric D. Chevalier}, Christine Braquart-Varnier, Pierre Grève, Patrick Mavingui, Heddi Abdelaziz1, Didier Bouchon \& Fabrice Vavre. \href{http://dx.doi.org/xx}{xx xx xx(xx):xx-x}.\\ \item \textit{Genomic analysis of a parasite invasion: Colonization of the Americas by the blood fluke Schistosoma mansoni.}. Roy N. Platt II, Winka Le Clec'h, \textbf{Frédéric D. Chevalier}, Marina McDew-White, Philip T. LoVerde, Rafael Ramiro de Assis, Guilherme Oliveira, Safari Kinung’hi, Amadou Garba Djirmay, Michelle L. Steinauer, Anouk Gouvras, Muriel Rabone, Fiona Allan, Bonnie L. Webster, Joanne P. Webster, Aidan M. Emery, David Rollinson \& Timothy JC. Anderson. \href{https://doi.org/10.1111/mec.16395}{Molecular Ecology 2022 31(8):2242-2263}.\\ \item \textit{Genetic analysis of praziquantel response in schistosome parasites implicates a transient receptor potential channel}. Winka Le Clec'h, \textbf{Frédéric D. Chevalier}, Ana Carolina Alves de Mattos, Amanda Strickland, Robbie Diaz, Marina McDew-White, Claudia M. Rohr, Safari Kinung’hi, Fiona Allan, Bonnie L. Webster, Joanne P. Webster, Aidan M. Emery, David Rollinson, Amadou Garba Djirmay, Khalid M. Al Mashikhi, Salem Al Yafae, Mohamed A. Idris, Hélène Moné, Gabriel Mouahid, Philip T. LoVerde, Jonathan S. Marchant \& Timothy JC. Anderson. \href{https://doi.org/10.1126/scitranslmed.abj9114}{Science Translational Medicine 2021 13(625):eabj9114}.\\ \item \textit{Genetic architecture of transmission stage production and virulence in schistosome parasites}. Winka Le Clec'h, \textbf{Frédéric D. Chevalier}, Marina McDew-White, Vinay Menon, Grace-Ann Arya \& Timothy JC. Anderson. \href{https://doi.org/10.1080/21505594.2021.1932183}{Virulence 2021 12(1):1508-1526}.\\ \item \textit{The hemolymph of \emph{Biomphalaria} snail vectors of schistosomiasis supports a diverse microbiome}. \textbf{Frédéric D. Chevalier}, Robbie Diaz, Marina McDew-White, Timothy JC. Anderson \& Winka Le Clec'h. \href{https://doi.org/10.1111/1462-2920.15303}{Environmental Microbiology 2020 22(12):5450-5466}.\\ \item \textit{Why does oxamniquine kill \emph{Schistosoma mansoni} and not \emph{S. haematobium} and \emph{S. japonicum}?} Anastasia R. Rugel, Meghan Guzman, Alexander B. Taylor, \textbf{Frédéric D. Chevalier}, Reid S. Tarpley, Stanton F. McHardy, Xiaohang Cao, Stephen P. Holloway, Timothy JC. Anderson, P. John Hart \& Philip T. LoVerde. \href{https://doi.org/10.1016/j.ijpddr.2020.04.0}{International Journal for Parasitology: Drugs and Drug Resistance 2020 13:8-15}.\\ \item \textit{Oxamniquine resistance alleles are widespread in {O}ld {W}orld \emph{Schistosoma mansoni} and predate drug deployment}. \textbf{Frédéric D. Chevalier}, Winka Le Clec’h, Marina McDew-White, Vinay Menon, Meghan A. Guzman, Stephen P. Holloway, Xiaohang Cao, Alexander B. Taylor, Safari Kinung’hi, Anouk N. Gouvras, Bonnie L. Webster, Joanne P. Webster, Aidan M. Emery, David Rollinson, Amadou Garba Djirmay, Khalid M. Al Mashikhi, Salem Al Yafae, Mohamed A. Idris, Hélène Moné, Gabriel Mouahid, P. John Hart, Philip T. LoVerde \& Timothy JC. Anderson. \href{https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1007881}{PLoS Pathogens 2019 15(10):e1007881}.\\ \item \textit{Ancient hybridization and adaptive introgression of an invadolysin gene in schistosome parasites}. Roy N. Platt, Marina McDew-White, Winka Le Clec'h, \textbf{Frédéric D. Chevalier}, Fiona Allan, Aidan M. Emery, Amadou Garba, Amina A. Hamidou, Shaali M. Ame, Joanne P. Webster, David Rollinson, Bonnie L. Webster \& Timothy JC. Anderson. \href{https://doi.org/10.1093/molbev/msz154}{Molecular Biology and Evolution 2019 36(10):2127-2142}.\\ \item \textit{Characterization of hemolymph phenoloxidase activity in two \emph{Biomphalaria} snail species and impact of \emph{Schistosoma mansoni} infection}. Winka Le Clec'h, Timothy JC. Anderson \& \textbf{Frédéric D. Chevalier}. \href{http://dx.doi.org/10.1186/s13071-016-1319-6}{Parasites \& Vectors 2016 9:32}.\\ \item \textit{Efficient linkage mapping using exome capture and extreme QTL in schistosome parasites}. \textbf{Frédéric D. Chevalier}, Claudia LL. Valentim, Philip T. LoVerde \& Timothy JC. Anderson. \href{http://dx.doi.org/10.1186/1471-2164-15-617}{BMC Genomics 2014 15:617}.\\ \item \textit{Genetic and molecular basis of drug resistance and species-specific drug action in Schistosome parasites}. Claudia LL. Valentim, Donato Cioli, \textbf{Frédéric D. Chevalier}, Xiaohang Cao, Alexander B. Taylor, Stephen P. Holloway, Livia Pica-Mattoccia, Alessandra Guidi, Annalisa Basso, Isheng J. Tsai, Matthew Berriman, Claudia Carvalho-Queiroz, Marcio Almeida, Hector Aguilar, Doug E. Frantz, P. John Hart, Philip T. LoVerde \& Timothy JC. Anderson. \href{http://dx.doi.org/10.1126/science.1243106}{Science 2013 342(6164):1385-9}.\\ \item \textit{Cannibalism and predation as paths for horizontal passage of \emph{Wolbachia} between terrestrial isopods}. Winka Le Clec'h, \textbf{Frédéric D. Chevalier}, Lise Genty, Joanne Bertaux, Didier Bouchon \& Mathieu Sicard. \href{http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0060232}{PLoS ONE 2013 8(4):e60232}.\\ \end{outerlist} \blankline \textit{Articles de revue} \begin{outerlist} \item \textit{Snails, microbiomes, and schistosomes: a three-way interaction?} Winka Le Clec’h, Stephanie Nordmeyer, Timothy JC. Anderson \& \textbf{Frédéric Chevalier}. \href{https://doi.org/10.1016/j.pt.2022.01.012}{Trends in Parasitology 2022 38(5):353-355}.\\ \item \textit{Rational approach to drug discovery for human schistosomiasis}. Philip T. LoVerde, Sevan N. Alwan, Alexander B. Taylor, Jayce Rhodes, \textbf{Frédéric D. Chevalier}, Timothy JC. Anderson \& Stanton F McHardy. \href{https://doi.org/10.1016/j.ijpddr.2021.05.002}{International journal for parasitology: Drugs and drug resistance 2021 16:140-147}.\\ \item \textit{Genetic crosses and linkage mapping in schistosome parasites}. Timothy JC. Anderson, Philip T. LoVerde, Winka Le Clec’h \& \textbf{Frédéric D. Chevalier}. \href{https://doi.org/10.1016/j.pt.2018.08.001}{Trends in Parasitology 2018 34(11):982-996}.\\ \end{outerlist} %--------------------- \section{Conférences} %--------------------- % \textit{Communications orales (\emph{\footnotemark[1]}présentateur, liste complète en annexe)} \begin{outerlist} \item \href{http://www.vppcb.fiocruz.br/16symposium-schisto/_en}{XVI$^{th}$ International Symposium on Schistosomiasis}: \textit{Field applicable methods for surveying drug resistance in schistosome populations}. \textbf{Frédéric D. Chevalier}\footnotemark[1], Winka Le Clec'h, Madison Morales, Eric M. Ndombi \& Timothy J.C. Anderson. Ouro Preto, Brazil, November 21$^{th}$ to 23$^{rd}$ 2022. \item \href{https://www.bio.tamu.edu/asp-97/}{97$^{th}$ Annual Meeting of the American Society of Parasitologists}: \textit{Genetic mapping of an adaptive parasite trait: larval release time in schistosomes.} Gabriel Mouahid, \textbf{Frédéric D. Chevalier}\footnotemark[1], Salem Al Yafae, Mohamed A. Idris, Juliette Langand, Marina McDew-White, Grace-Ann Arya, Timothy JC. Anderson \& Hélène Moné. College Station, Texas, USA, July 9$^{th}$ to 12$^{th}$ 2022. \item \href{https://www.bio.tamu.edu/asp-97/}{97$^{th}$ Annual Meeting of the American Society of Parasitologists}: \textit{The impact of schistosome infection on \emph{Biomphalaria glabrata} host snail microbiome.} Stephanie Nordmeyer\footnotemark[1], Timothy J.C. Anderson, textbf{Frédéric D. Chevalier} \& Winka Le Clec'h. College Station, Texas, USA, July 9$^{th}$ to 12$^{th}$ 2022. \item \href{http://bsp.uk.net/2020/07/24/parasites-online-2021/}{British Society for Parasitology Conference}: \textit{Bulk segregant analysis of host specificity in schistosome parasites.} \textbf{Frédéric D. Chevalier}\footnotemark[1], Winka Le Clec'h, Philip T. LoVerde, Benjamin Gourbal, Guillaume Mitta \& Timothy JC. Anderson. Cyberspace, June 21$^{st}$ to 27$^{th}$ 2021. \item \href{http://bsp.uk.net/2020/07/24/parasites-online-2021/}{British Society for Parasitology Conference}: \textit{How much variation in drug response is found in schistosome populations?} Winka Le Clec'h\footnotemark[1], \textbf{Frédéric D. Chevalier}, Robbie Diaz, Amanda Strickland, Madison Morales \& Timothy JC. Anderson. Cyberspace, June 21$^{st}$ to 27$^{th}$ 2021. \item {Molecular Helminthology 2021}: \textit{Extreme QTL analysis of host specificity in schistosome parasites.} \textbf{Frédéric D. Chevalier}\footnotemark[1], Winka Le Clec'h, Philip T. LoVerde, Benjamin Gourbal, Guillaume Mitta \& Timothy JC. Anderson. Cyberspace, June 2$^{nd}$ to 4$^{th}$ 2021. \item {Molecular Helminthology 2021}: \textit{Genetic approaches to understanding drug resistance in Schistosome parasites.} Winka Le Clec'h\footnotemark[1], \textbf{Frédéric D. Chevalier}, Philip LoVerde, Jonathan S. Marchant \& Timothy JC. Anderson. Cyberspace, June 2$^{nd}$ to 4$^{th}$ 2021. \item \href{https://www.astmh.org/annual-meeting/past-meetings}{68$^{th}$ American Society of Tropical Medicine and Hygiene Annual Meeting}: \textit{The genetic basis of praziquantel resistance in \emph{Schistosoma mansoni}.} Winka Le Clec’h, \textbf{Frédéric D. Chevalier}, Marina McDew-White, Robbie Diaz, Amanda Strickland, Meghan Guzman, Ana Carolina Alves de Mattos, Philip T. LoVerde \& Tim Anderson\footnotemark[1]. National Harbor, Maryland, USA, November 20$^{th}$ to 24$^{th}$ 2019. \item \href{http://www.afbr-bri.com/schistosomiasis/siris-2/}{1$^{st}$ Symposium for International Research and Innovation in Schistosomiasis}: \textit{Genetic analysis of transmission-related traits in \emph{Schistosoma mansoni}}. Winka M. Le Clec’h\footnotemark[1], \textbf{Frédéric D. Chevalier} \& Timothy J. Anderson. Washington, DC, USA, February 3$^{rd}$ to 4$^{th}$ 2016. \item \href{http://www.astmh.org/Meeting_Archives.htm}{64$^{th}$ American Society of Tropical Medicine and Hygiene Annual Meeting}: \textit{"Extreme" QTL methods for genetic mapping of drug resistance and host specificity in Schistosome parasites}. \textbf{Frédéric D. Chevalier}\footnotemark[1], Winka Le Clec’h, Philip LoVerde \& Tim J. Anderson. Philadelphia, PA, USA, October 25$^{th}$ to 29$^{th}$ 2015. \end{outerlist} \blankline \\~ \blankline \textit{Communications affichées (\emph{\footnotemark[1]}présentateur, liste complète en annexe)} \begin{outerlist} \item \href{http://bsp.uk.net/2020/07/24/parasites-online-2021/}{British Society for Parasitology Conference}: \textit{An atlas of organ microbiomes of \emph{Biomphalaria} spp., the snail host of schistosome parasites.} \textbf{Frédéric D. Chevalier}\footnotemark[1, ]Lauren V. Carruthers, Stephanie Nordmeyer, Timothy JC. Anderson \& Winka Le Clec’h. Cyberspace, June 21$^{st}$ to 27$^{th}$ 2021. \item {Texas Biomed Research Symposium}: \textit{Development of functional genomic tools for gene knockdown in schistosome larval stages infecting aquatic snails.} Marina McDew-White\footnotemark[1], Winka Le Clec’h, \textbf{Frédéric D. Chevalier} \& Timothy JC. Anderson. San Antonio, Texas, USA, February 18$^{th}$ to 19$^{th}$ 2020. \item \href{https://register.extension.iastate.edu/anthelmintics}{Anthelminthics: Discovery to resistance IV}: \textit{Genetic basis of meclonazepam resistance in \emph{Schistosoma mansoni}.} Winka Le Clec'h\footnotemark[1], \textbf{Frédéric D. Chevalier}, Amanda Strickland, Robbie Diaz, John D. Chan \& Tim JC. Anderson. Santa Monica, California, USA, February 3$^{rd}$ to 7$^{th}$ 2020. \item {Society of Molecular Biology and Evolution 2017}: \textit{Improving the \emph{Schistosoma mansoni} genome assembly using genetic crosses and linkage analysis.} \textbf{Frédéric D. Chevalier}\footnotemark[1], Winka Le Clec’h, Gabriel Mouahid, Hélène Moné, Mohamed A. Idris, Salem Al Yafae, Juliette Langand, Nancy Holroyd, Alan Tracey, Matthew Berriman \& Tim JC. Anderson. Austin, TX, USA, July 2$^{nd}$ to 6$^{th}$ 2017. \item {SMBE Satellite Workshop on the Genetics of Admixed Populations}: \textit{Genomic analysis of hybridization in schistosome parasites}. Winka M. Le Clec’h\footnotemark[1], \textbf{Frédéric D. Chevalier}, Marina McDew-White, Bonnie Webster, David Rollinson \& Timothy J. Anderson. San Antonio, TX, USA, May 18$^{th}$ to 20$^{th}$ 2016. \item \href{http://www.afbr-bri.com/schistosomiasis/siris-2/}{1$^{st}$ Symposium for International Research and Innovation in Schistosomiasis}: \textit{Invertebrate immunity: Phenoloxidase activity in the schistosome snail host}. Winka M. Le Clec’h\footnotemark[1], \textbf{Frédéric D. Chevalier} \& Timothy J. Anderson. Washington, DC, USA, February 3$^{rd}$ to 4$^{th}$ 2016. \item \href{http://www.astmh.org/Meeting_Archives.htm}{64$^{th}$ American Society of Tropical Medicine and Hygiene Annual Meeting}: \textit{Genetic linkage analysis of praziquantel resistance}. Ana Carolina Alves de Mattos, \textbf{Frédéric D. Chevalier}\footnotemark[1], Winka LeClec’h, Paulo Marcos Zech Coelho, Flavia Couto, Timothy J. Anderson \& Philip T. LoVerde. Philadelphia, PA, USA, October 25$^{th}$ to 29$^{th}$ 2015. \item \href{http://sites.univ-provence.fr/evol-cgr/index.php?option=com_content&view=article&id=54&Itemid=42}{19$^{th}$ Evolutionnary Biology Meeting}: \textit{Genetic analysis of transmission-related traits in schistosome parasites}. Winka Le Clec'h\footnotemark[1], \textbf{Frédéric D. Chevalier} \& Tim J. Anderson. Marseilles, France, September 15$^{nd}$ to 18$^{th}$ 2015. \item \href{https://www.eseb2013.com/}{XIV Congress of the European Society for Evolutionary Biology}: \textit{Accurate exome sequencing in a microscopic invertebrate}. \textbf{Frédéric D. Chevalier}\footnotemark[1], Philip T. LoVerde \& Timothy JC. Anderson. Lisbon, Portugal, August 19$^{th}$ to 24$^{th}$ 2013. \end{outerlist} %-------------------------------- \section{Services scientifiques} %-------------------------------- % \textit{Activité de relecture} \begin{outerlist} \item[] Relecteur pour \href{https://www.journals.elsevier.com/computational-and-structural-biotechnology-journal}{Computational and Structural Biotechnology Journal}, \href{https://www.frontiersin.org/journals/cell-and-developmental-biology}{Frontiers in Cell and Developmental Biology}, \href{https://www.frontiersin.org/journals/microbiology}{Frontiers in Microbiology}, \href{http://www.elsevier.com/wps/find/journaldescription.cws_home/506033/description#description}{Gene}, \href{https://www.journals.elsevier.com/international-journal-for-parasitology}{International Journal for Parasitology}, \href{https://www.journals.elsevier.com/infection-genetics-and-evolution}{Journal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics of Infectious Diseases}, \href{http://www.journals.elsevier.com/meta-gene/}{Meta Gene}, \href{https://www.mdpi.com/journal/microorganisms}{Microorganisms}, \href{http://www.journals.elsevier.com/molecular-and-biochemical-parasitology/}{Molecular \& Biochemical Parasitology}, \href{https://onlinelibrary.wiley.com/journal/1365294x}{Molecular Ecology}, \href{https://www.mdpi.com/journal/pathogens}{Pathogens}, \href{http://www.pnas.org/}{Proceedings of the National Academy of Sciences}, \href{http://journals.plos.org/plospath/}{PLOS Pathogens}, \href{http://journals.plos.org/plosntds/}{PLOS Neglected Tropical Diseases}, \href{http://www.plosone.org/}{PLoS ONE}. \item[] \end{outerlist} \textit{Adhésion aux sociétés savantes} \begin{outerlist} \item Membre de la \emph{Society for Molecular Biology \& Evolution} (SMBE) \hfill \textbf{Mai 2017 à 2019} \item Membre de l'\emph{American Society of Parasitologists} (ASP) \hfill \textbf{Mai 2017 à Mai 2018} \item Membre de l'\emph{American Society of Parasitologists} (ASP) \hfill \textbf{Mai 2022 à Mai 2023} \item Membre de l'\emph{American Society of Tropical Medicine and Hygiene} (ASTMH) \hfill \textbf{Octobre 2015 à Octobre 2016} \end{outerlist} %------------------------- \section{Responsabilités} %------------------------- % \textbf{Responsabilités administratives} \begin{outerlist} \item[] \textit{Plan stratégique du Texas Biomed} \begin{innerlist} \item Membre de l'équipe d'implémentation, co-champion de l'équipe d'action \emph{Formation et Développement de carrière} \hfill \textbf{Juillet 2018 à Mars 2020} \item Membre de l'équipe de réflexion, co-leader de l'équipe d'action \emph{Formation et Développement de carrière} \hfill \textbf{Septembre 2017 à Juillet 2018} \end{innerlist} \item[] \textit{Membre du commité de dissémination scientifique} \hfill \textbf{Mars 2018 à Mars 2020} \item[] Représentant des doctorants à l'\href{http://ed-icbg.univ-poitiers.fr/}{École Doctorale ICBG} \hfill \textbf{Octobre 2007 à Juin 2009} \item[] Représentant des moniteurs auprès du \href{http://www.ciescentre.fr/index.php?id=3}{CIES Centre} \hfill \textbf{Octobre 2007 à Juin 2009}% \end{outerlist} \blankline \textbf{Responsabilités associatives} \begin{outerlist} \item[] \textit{\href{http://moniteurs.poitiers.free.fr/index.php/TEMPO/TEMPO}{TEMPO} (Thésards Et Moniteurs de POitiers)} \begin{innerlist} \item Vice-président de l'association \hfill \textbf{Mai 2008 à Mai 2009} \item Président de l'association \hfill \textbf{Mai 2009 à Mai 2010} \end{innerlist} \item[] \textit{\href{http://adbep.asso.univ-poitiers.fr/index.html}{ADBEP} (Association des Doctorants en Biologie et Ecologie de Poiters)} \begin{innerlist} \item Secrétaire de l'association \hfill \textbf{Octobre 2008 à Octobre 2009} \item Représentant de l'association auprès du réseau \href{http://www.biotechno.asso.fr/}{BioTechno} \end{innerlist} \end{outerlist} %------------------------------------------------------------------------------------ \section{Activités de diffusion et d'information sur l'enseignement et la recherche} %------------------------------------------------------------------------------------ % \textbf{Diffusion scientifique} \begin{outerlist} \item[] \textit{Family night} \hfill \textbf{2018 à 2019} \item[] \textit{School tours at Texas Biomed} \hfill \textbf{2012 à 2019} \item[] \textit{Fête de la Science} \begin{innerlist} \item Présentation des thématiques du laboratoire Écologie, Évolution, Symbiose au grand public \hfill \textbf{Novembre 2009 et Octobre 2007} \end{innerlist} \end{outerlist} %\blankline % %\textbf{Information sur l'enseignement} %\begin{outerlist} %\item[] \textit{Journées Portes Ouvertes de l'Université} % \begin{innerlist} % \item Présentation des différents parcours du département d'enseignement Biologie des Organismes et des Populations \hfill \textbf{Janvier 2010 et Février 2009} % \begin{innerlist2} % \item Présentation des parcours Licences % \item Présentation du Master Recherche Biologie, Écologie, Évolution % \item Présentation du Master \textit{Erasmus Mundus} EMAE (European Master in Applied Ecology) % \item Présentation du Master Professionnel Génie Écologique % \end{innerlist2} % \end{innerlist} %\end{outerlist} %%---------------------------------------------- %\section{Participation aux Écoles Thématiques} %%---------------------------------------------- %% %\href{http://www.agri.huji.ac.il/index-eng.html}{\textbf{Université Hébraïque de Jérusalem}}, Rehovot, Israël %\begin{outerlist} %\item[] \textit{\href{http://www.cost-fa0701.com/}{COST Training School} - Advances in Symbiosis Research} \hfill \textbf{13 au 19 Mars 2009} % \begin{innerlist} % \item Objectifs : état des lieux des avancés dans le domaine de la recherche sur la symbiose dans le cadre du COST Action FA0701. % \item Responsable : % \href{mailto:yuval@agri.huji.ac.il} % {Professeur Boaz YUVAL} % \item Thème : étude des symbioses et techniques associées. % \end{innerlist} %\end{outerlist} %%-------------------------------- %\section{Compétences techniques} %%-------------------------------- %% %\textit{Compétences expérimentales} %\begin{outerlist} % \item Acides nucléiques : extraction d'ADN, extraction d'ARN, Southern, Northern, PCR, RT-PCR, qPCR, RT-qPCR, construction de banques d'ADNc, banques soustractives (SSH), clonage, séquençage, hybridation \textit{in situ} % \item Protéines : Western blot, quantification d'activité enzymatique, expression de protéines en système hétérologue, détection d'interactions (double hybride), purification de protéines par HPLC % \item Biologie cellulaire : cytométrie en flux, marquage apoptose (marquage TUNEL et Annexin), immunomarquage, séparation de cellules sur gradient, comptage manuel et automatique de densités cellulaires, microscopie épifluorescente, microscopie confocale, préparation d'échantillons pour la microscopie électronique % \item Microbiologie : cultures de champignons, cultures de bactéries, injections de bactéries %\end{outerlist} % %\blankline % %\textit{Compétences en bioinformatique} %\begin{outerlist} % \item Recherche de similarités de séquences nucléiques : \href{http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi}{\textsc{Blast}} (blast local et en ligne) % \item Recherche de similarités de domaines protéiques : ProScan, Conserved Domain Search % \item Alignement de séquences nucléiques et protéiques : \href{http://www.mbio.ncsu.edu/BioEdit/bioedit.html}{\textsc{Bioedit}}, Clustal, \href{http://bioinfo.genotoul.fr/multalin/multalin.html} {\textsc{Multalin}}, \textsc{Mafft}, \textsc{Prank}, Guidance %\end{outerlist} %---------------------------- \section{Autres compétences} %---------------------------- \textit{Compétences informatiques} \begin{outerlist} \item Logiciels statistiques : programmes R et Julia \item Programmation : conception de scripts UNIX shell (bash), de scripts R et Python \item Maîtrise d'outils bureautiques : Microsoft Office, OpenOffice, LibreOffice pour plateformes Windows ou GNU/Linux, \TeX{}, \LaTeX{}, B\textsc{ib}\TeX{}, \item Maîtrise de systèmes d'exploitation : GNU/Linux (Distributions Ubuntu, Mandriva, Debian), Microsoft Windows (7/10) \end{outerlist} \blankline \textit{Compétences linguistiques} \begin{outerlist} \item Anglais : lu, écrit, parlé couramment (10 ans de vie aux États-Unis) \item Espagnol : lu, écrit \item Latin : lu, écrit \end{outerlist} %-------- % Annexe %-------- % %\include{"F.\space CHEVALIER\space -\space CV\space appendix"} \input{"F. CHEVALIER - CV appendix.tex"} \end{document} %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% End CV Document %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%